消除脑积水形成前的危险因素和胎儿期、围产期导致此疾病的因素关键在于预防脑积水的发生。
1、改善与杜绝遗传因素和环境因素
遗传因素和环境因素的共同作用所致的多因子疾病会导致先天性脑积水的发生。遗传因素很重要，但环境因素中的病毒和弓形虫的感染还是对胎儿的发育影响还是较大的，它可导致胎儿严重的先天性畸形，例如脑积水。除此之外，怀孕早期的辐射因素也会导致先天性脑积水。
避免此病的发生，应当做好婚前检查、禁止近亲结婚、遗传的咨询等一些工作，随着强制婚检的的取消，孕前指导、孕前检查、孕前预防性的治疗也成为预防先天性脑积水的重要保障。
2、产前的早期诊断，及早终止妊娠
加强产前的早期诊断可以预防先天性脑积水。较明显的患儿可在孕期的12-18周通过B超查出来。一旦查明病因，应及早终止妊娠，预防脑积水患儿的出生。
3、注意分娩的安全性，避免感染的反生
分娩时应当注意避免胎儿窒息，防止产伤;在产后保健期中，早产儿需要有早产的监护，足月后进行足月的处理，避免感染的发生。这些都是预防脑积水发生的重要环节，孕妈妈要注意啦。