细菌侵人新生儿体内，并在血中繁殖，临床上称为败血症。在血液中繁殖的细菌，又可随着血液循环被送到全身各处，所到之处均可引起局部发炎。例如细菌随血流进人胸腔可引起胸膜炎，到脑子可引起脑膜炎，到心包可引起心包炎等等，甚至同时可以存在几个感染性病灶，医学上称为脓毒败血症。
新生儿免疫功能低下，皮下血管丰富是任何轻微感染都易导致败血症的主要原因。
细菌人畏的门户，不外乎新生儿的皮肤、消化道和呼吸道的枯膜以及脐带等与外界环境直接接触的地方。细菌侵入体内后，由于新生儿免疫功能不足、局限能力差，很快就可以通过皮肤及粘膜的丰富毛细血管网扩散到全身。
母亲子宫息严重的感染性疾病时，细菌可以通过血行、胎盘及脐带直接进人胎儿血液中，引起败血症，也可以先将羊水污染，而后通过污染的羊水再将完全浸泡在羊水中的胎儿感染，引起败血症。这叫官内感染。在分娩时由于羊膜过早破裂，母亲阴道内的细菌可逆行到羊膜内，通过被污染的羊水间接侵人胎儿体内，也可因生产不顺利，胎儿在产道时间拖长可使新生儿受到细菌的畏袭而得病。这种在生产过程细菌畏人体内而引起的败血症叫产时感染。在宫内及生产过程感染的败血症，多半在3天内发病，以大肠杆菌及链球菌感染为主。产后感染的败血症，发病较晚，多在3天后发病，以葡萄球菌感染为主。