不良妊娠结局包括自然流产、早产(孕<37周)、死胎、异位妊娠、葡萄胎、出生缺陷、低出生体质量等，占妊娠的5％～20％。从不同地区、不同阶层及不同年龄统计，自然流产的发生率约为15%～40%；2次或2次以上的流产患者约占生育期妇女的5%；而3次或3次以上者（3次或3次以上在妊娠28周之前的胎儿丢失称习惯性流产）约占1%～2%。与此同时，我国出生缺陷儿每年高达80～120万，占每年出生人口总数的4%～6%。
不良妊娠结局已成为影响儿童健康和出生人口素质的重大公共卫生问题，也是造成儿童残疾和儿童死亡的主要原因，给社会和家庭带来沉重的经济负担，影响出生人口素质和家庭和谐幸福。
现代医学认为，不良妊娠结局的相关因素很多，如母体因素、胚胎和环境因素等，这些危险因素影响着孕妇的健康，对子宫内环境形成了不良刺激，导致胎盘基因表达水平改变，胎盘功能障碍，从而影响胎儿宫内正常生长，有些甚至与婴儿成人后代谢性疾病和神经系统紊乱发生风险的增加呈正相关。
大量的流行病学和临床研究证实叶酸代谢过程中任何环节出现障碍，均可导致与叶酸代谢密切相关疾病和流产的发生风险增加，其中5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因突变是导致叶酸代谢障碍的重要因素之一。同时，也是导致不良妊娠结局的重要因素。
自然流产与MTHFR基因突变
MTHFR等位基因基因677C/T突变可能通过高Hcy血症引起胚胎丢失。MTHFR基因位点的突变可直接导致MTHFR活性下降，进而引发机体内同型半胱氨酸(Hcy)转化成甲硫氨酸减少，最终血Hcy水平升高。
高Hcy血症可产生大量的过氧化物和氧自由基，进而抑制血管内皮细胞一氧化氮的合成和释放导致血管功能异常和内皮细胞受损。高同型半胱氨酸水平还可破坏机体凝血与纤溶之间的平衡，使机体处于血栓前状态，加速了动脉粥样硬化和动脉血栓的形成。如果胎盘动脉出现栓塞，则可引发胚胎供血不足、绒毛坏死，进而引起自然流产的发生。研究显示，在孕8～9周，同型半胱氨酸>10umol/l，胎死宫内的危险性增加2倍；当同型半胱氨酸>15umol/l，自然流产的发生率增加7倍。
另外，MTHFR等位基因基因677C/T突变可能通过影响DNA甲基化引起胚胎丢失。MTHFR等位基因基因677C/T突变导致MTHFR活性下降，使5-甲基四氢叶酸生成减少，嘌呤、嘧啶、核酸代谢障碍，胎儿生长发育所必须DNA和蛋白质合成减少，并导致DNA和蛋白质的甲基化异常引起自然流产。研究发现：基因型为TT和CT的女性其发生复发性流产的风险较基因型为CC者分别高267%和62%；T等位基因携带者发生复发性流产的风险较C等位基因携带者高89%。母亲MTHFR突变杂合子和纯合子发生反复早期流产的危险性比未突变纯合子分别增加8.75倍和9.33倍。
先心病与MTHFR基因突变
研究发现先心病（先天性动脉导管未闭、房间隔缺损）的发生与MTHFR677T等位基因突变密切相关。MTHFR677T等位基因突变导致叶酸代谢障碍，进而引起甲基化不足和Hcy升高，高Hcy通过激发某些信号，诱导和改变细胞凋亡发生，从而诱导心脏畸形的发生。例如，在孕期服用叶酸拮抗剂后，生育先心病后代的风险增加2倍。相反，在孕早期补充足量叶酸和维生素B12后可显着降低新生儿患先心病的风险。
神经管畸形与MTHFR基因突变
MTHFR等位基因突变是导致神经管畸形的重要因素之一。研究发现母体677TT纯合子突变生育神经管畸形患儿风险增加2倍。胎儿677TT纯合突变增加发生神经管畸形风险1.6倍。如胎儿和母亲均为MTHFR677T纯合子，则发生神经管畸形的风险增高7倍。另外，MTHFR基因1298AC杂合子婴儿和母亲发生神经管畸形的机率分别增加1.98倍和2.11倍，而1298CC纯合子母亲发生神经管畸形的机率增加6.23倍。
唇腭裂与MTHFR基因突变
MTHFR等位基因突变还是诱发唇腭裂的重要因素。研究发现有唇腭裂生育史的人群C66T的纯合突变是正常人的3倍。MTHFR677TT基因型孕前未服用叶酸、低叶酸饮食或二者兼具的母亲出生唇腭裂儿的风险分别升高5.9倍、2.8倍和10.1倍。MTHFRl298CC基因型母亲如未补充叶酸且低叶酸饮食，则出生唇腭裂儿的风险升高6.5倍。MTHFR等位基因突变后，导致叶酸代谢障碍，机体内甲基供给不足，DNA甲基化程度降低，进而影响DNA对细胞发育和分化的正常调控，最终引起胚胎发育异常。
唐氏综合症与MTHFR基因突变
MTHFR等位基因突变还是唐氏综合症的重要致病因素，这可能与DNA甲基化不足有关。MTHFR等位基因突变后5-甲基四氢叶酸合成降低，从而导致甲硫氨酸和S-腺苷甲硫氨酸(SAM)合成不足，使Hcy和S-腺苷同型半胱氨酸(SAH)堆积，SAM/SAH比值降低，导致DNA转甲基转移酶活性受到抑制，出现DNA低甲基化，使生殖细胞在减数分裂过程中21号染色体不分离。
中国仓鼠卵在无叶酸培养基中培养，染色体畸变率（包括染色体裂痕、染色体断裂等）高于对照组10倍。研究发现在通过饮食造成叶酸缺乏超过5周组的小鼠，其DNA断裂的发生明显高于叶酸基础量组的小鼠。同时喂食叶酸4倍于基础量组的小鼠的p53的稳定性明显高于基础量组和叶酸完全缺乏组。
研究表明，具有677T等位基因的母亲比677CC基因型母亲生育唐氏综合征儿的风险升高2.6倍。另有研究表明，母亲MTHFR基因677C→T突变者在同时存在蛋氨酸化合酶(MTRR)基因66A→G突变时，生育唐氏综合征儿的风险增加4.08倍。
中国疾控妇女保健中心指出：
所有育龄妇女都应进行叶酸利用能力遗传检测，个性化补充叶酸，以降低新生儿出生缺陷发生率！
备孕/孕妈咪应该通过叶酸利用能力遗传检测，进而有针对性的调整叶酸补充剂量，从而个性化补充叶酸，让补充叶酸更具有针对性。